Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
COL4A6Q14031 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms