Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SHROOM2Q13796 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SHROOM2Q13796 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms