Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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