Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms