Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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