Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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BPTFQ12830 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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BPTFQ12830 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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BPTFQ12830 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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BPTFQ12830 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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BPTFQ12830 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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BPTFQ12830 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
BPTFQ12830 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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