Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms