Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CENPCQ03188 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms