Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CENPEQ02224 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CENPEQ02224 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms