Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRPF3Q9ULD4 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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