Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM53CQ9NYF3 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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