Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL390726.2-201ENST00000504791 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL591866.1-201ENST00000456162 401 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL580P-201ENST00000492489 287 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms