Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.56□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
IMPG1Q17R60 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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