Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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GRIK4Q16099 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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GRIK4Q16099 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
GRIK4Q16099 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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