Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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