Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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TAF1AQ15573 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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