Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PTPRKQ15262 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PTPRKQ15262 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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PTPRKQ15262 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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PTPRKQ15262 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRKQ15262 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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