Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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