Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SHPRHQ149N8 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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SHPRHQ149N8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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SHPRHQ149N8 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SHPRHQ149N8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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