Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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