Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF235Q14590 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF235Q14590 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF235Q14590 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF235Q14590 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF235Q14590 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF235Q14590 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF235Q14590 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms