Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBB2AQ13885 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms