Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HTR4Q13639 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms