Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CDH18Q13634 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms