Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CUL1Q13616 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CUL1Q13616 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CUL1Q13616 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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