| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.234-201 | ENST00000364409 | 97 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02089-201 | ENST00000412360 | 682 nt | TSL 2 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC245052.5-201 | ENST00000416320 | 649 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC104653.2-201 | ENST00000435407 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | USP9YP7-201 | ENST00000436723 | 430 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | COX6CP2-201 | ENST00000444980 | 225 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL360221.1-201 | ENST00000445989 | 335 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | COX6CP12-201 | ENST00000446748 | 202 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPS17P13-201 | ENST00000448974 | 407 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL354754.1-201 | ENST00000449730 | 625 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | HMGB3P22-202 | ENST00000451823 | 572 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NAE1 | Q13564 | SCEL-AS1-201 | ENST00000456280 | 493 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC068724.1-201 | ENST00000487100 | 792 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC006390.1-201 | ENST00000508068 | 283 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.695-201 | ENST00000516715 | 107 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC018437.2-201 | ENST00000517369 | 389 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP003472.1-201 | ENST00000519844 | 644 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | LRRTM2-203 | ENST00000521094 | 1182 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | UNC13C-202 | ENST00000539562 | 938 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC018410.2-201 | ENST00000540410 | 610 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC068397.1-201 | ENST00000560337 | 531 nt | TSL 2 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC007495.1-203 | ENST00000569025 | 888 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC244505.7-201 | ENST00000599675 | 272 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC004853.1-201 | ENST00000604902 | 698 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | BX088723.1-201 | ENST00000637785 | 708 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL353746.1-201 | ENST00000566293 | 6881 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL390237.1-201 | ENST00000404226 | 1415 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| NAE1 | Q13564 | RFX7-201 | ENST00000559447 | 10426 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCEL-201 | ENST00000349847 | 2386 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND4P4-201 | ENST00000439033 | 1366 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | DTHD1-205 | ENST00000507598 | 2606 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | TAX1BP1-213 | ENST00000543117 | 3365 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL049780.3-201 | ENST00000624612 | 1583 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | KIFAP3-202 | ENST00000367765 | 4111 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | USP26-201 | ENST00000370832 | 3642 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | BDP1P-201 | ENST00000582658 | 1990 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPINK1-201 | ENST00000296695 | 542 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.201-201 | ENST00000364052 | 96 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP97-201 | ENST00000365006 | 84 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | U8.14-201 | ENST00000390843 | 143 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-837P-201 | ENST00000391056 | 108 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTCYBP36-201 | ENST00000404146 | 440 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | BTF3L4P1-201 | ENST00000413813 | 468 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | MORF4L1P6-201 | ENST00000418771 | 268 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | OR8F1P-201 | ENST00000425243 | 930 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC004975.1-201 | ENST00000428733 | 208 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC010153.1-201 | ENST00000432862 | 727 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC091862.1-201 | ENST00000438016 | 1100 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL360089.1-201 | ENST00000442260 | 436 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | GDI2P2-201 | ENST00000445131 | 608 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | CDC27P1-201 | ENST00000445384 | 715 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC018731.1-201 | ENST00000447078 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | NUTM2A-AS1-209 | ENST00000447424 | 571 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01005-202 | ENST00000451440 | 531 nt | TSL 4 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC112229.2-201 | ENST00000456683 | 476 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC096554.1-201 | ENST00000458182 | 529 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | CHRM3-AS2-203 | ENST00000458325 | 895 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP001025.2-201 | ENST00000490908 | 477 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL139147.1-201 | ENST00000502413 | 1156 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | CTD-2350J17.1-202 | ENST00000510456 | 360 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC091965.2-201 | ENST00000512324 | 613 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC022118.1-201 | ENST00000512352 | 547 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU4ATAC6P-201 | ENST00000516592 | 126 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-714P-201 | ENST00000516963 | 103 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC087341.1-201 | ENST00000521490 | 491 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AF233439.1-201 | ENST00000526235 | 401 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC073651.3-201 | ENST00000545999 | 417 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC013437.1-201 | ENST00000549878 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL035425.2-201 | ENST00000563887 | 563 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTCYBP33-201 | ENST00000575007 | 1130 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC044873.1-201 | ENST00000580487 | 399 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | ABBA01006766.1-201 | ENST00000584728 | 294 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF573-209 | ENST00000585724 | 453 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC040904.1-201 | ENST00000590850 | 223 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC012065.4-201 | ENST00000602445 | 679 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | FBXW7-AS1-201 | ENST00000605147 | 372 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL365503.1-201 | ENST00000605247 | 905 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL359715.5-201 | ENST00000623431 | 443 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC068137.4-201 | ENST00000638485 | 296 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMCO5A-203 | ENST00000558158 | 2894 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC110597.3-202 | ENST00000583493 | 3289 nt | TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC092447.10-201 | ENST00000620607 | 1652 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC110760.2-201 | ENST00000508031 | 2546 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | XIRP2-204 | ENST00000409273 | 12269 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | ENPP3-202 | ENST00000358229 | 3026 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR181A1HG-203 | ENST00000436880 | 2308 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | NR5A2-201 | ENST00000236914 | 3115 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | POLK-201 | ENST00000241436 | 5911 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | ERBIN-214 | ENST00000511297 | 4257 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC090337.1-201 | ENST00000579651 | 2074 nt | BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPA17-201 | ENST00000227135 | 853 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.76 | □□□□□ -1.81 | | |