Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NAE1Q13564 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
NAE1Q13564 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms