Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NEUROD1Q13562 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms