Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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TCOF1Q13428 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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TCOF1Q13428 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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TCOF1Q13428 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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TCOF1Q13428 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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TCOF1Q13428 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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TCOF1Q13428 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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