Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SKP2Q13309 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms