Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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