Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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