Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CHAF1BQ13112 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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