Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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USP4Q13107 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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USP4Q13107 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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USP4Q13107 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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