Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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