Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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