Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PRDM2Q13029 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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