Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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