Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CENPFP49454 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CENPFP49454 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CENPFP49454 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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CENPFP49454 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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CENPFP49454 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CENPFP49454 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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