Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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PTPRDP23468 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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