Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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