Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM53CQ9NYF3 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms