Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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