Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
C2orf48Q96LS8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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