Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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CCDC142Q17RM4 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CCDC142Q17RM4 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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