Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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