Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PDK4Q16654 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PDK4Q16654 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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