Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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