Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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