Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CSRP2Q16527 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms