Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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NTRK3Q16288 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NTRK3Q16288 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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NTRK3Q16288 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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